Usando una microdisección de captura con láser de células, se secuenció un grupo de células teñidas con el marcador de interés. En otra cohorte de pacientes (todo esto es tejido de hígado humano) se secuenció todo el tejido (RNA-seq en ambos casos)
¿Puedo estimar la contribución de las células marcadas en todo el hígado ("peso de estas células "en el hígado en palabras de mi IP)?
Mi intuición es que no se puede hacer de esta manera, se requeriría tanto la secuenciación de una sola célula como la secuenciación de tejido completo para estimar la contribución de cada línea celular. Pero tal vez haya una herramienta que, dadas las líneas celulares o la expresión principal de otras líneas celulares, se pueda comparar con el uso de GSVA o alguna herramienta similar.