Bioinformática
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¿Cómo se puede estimar la contribución de la línea celular a partir de los datos de RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
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Cuantificar lecturas mapeadas a múltiples loci
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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¿Existe algún conjunto de datos multiómicos disponible públicamente?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Reasignación de coordenadas genómicas para tener en cuenta los indeles
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Tienen motivos de ADN de 6-12 pb de largo, tratando de obtener puntajes de conservación.
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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¿Es posible realizar la secuenciación de MinION sin conexión?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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¿Cómo puedo mejorar el rendimiento de las ejecuciones de secuenciación de MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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¿Cómo puedo detectar sistemáticamente secuencias desconocidas de códigos de barras / adaptadores dentro de un conjunto de muestras?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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¿Qué herramientas pueden detectar ARN quimérico (genes de fusión) a partir de datos de WGS o RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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¿Cómo transferir anotaciones gff en el genoma con duplicaciones extensas?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Trabajar con compilaciones de genoma antiguo
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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¿Tiene sentido recalibrar las puntuaciones para las llamadas variantes?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Descarga de un genoma de referencia para Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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URL de descarga estables
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Variante estructural que requiere datos PacBio de baja cobertura
asked 2017-06-01 04:46:41 UTC
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Imputación de genotipos faltantes de paneles de genotipado separados
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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¿Existe alguna alternativa RepBase para anotaciones de elementos repetidos en todo el genoma?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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¿Cuál es la diferencia entre las versiones 4.1 y 4.2 de la especificación VCF?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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¿Cómo seleccionar estructuras de alta calidad del Protein Data Bank?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Estimación de la pureza / contaminación / mezcla tumoral
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Usando shells que no sean bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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¿Cuál es la forma más rápida de calcular la cantidad de nucleótidos desconocidos en archivos FASTA / FASTQ?
asked 2017-06-01 21:47:03 UTC
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¿Cómo se calcula exactamente la "longitud efectiva" en FPKM?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Faltan genes y normalización de la salida de RSEM usando EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Encontrar la ubicación y la unidad de longitud de secuencias repetitivas dentro de una lectura larga
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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¿Solucionadores genéricos de HMM en bioinformática?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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¿Existen bases de datos de plantillas para formatos de archivos bioinformáticos comunes?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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validar subpoblaciones identificadas de células en scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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¿Cuáles son todos los archivos de referencia producidos por bwa index, y dependen de si la referencia está comprimida?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
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¿Por qué los archivos BAM creados por diferentes herramientas tienen diferentes tamaños de archivo?
asked 2017-06-03 04:38:14 UTC
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¿Cómo puedo reducir la resolución de un archivo BAM manteniendo ambas lecturas en pares?
asked 2017-06-03 04:44:45 UTC
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¿Cuál es la diferencia entre samtools, bamtools, picard, sambamba y biobambam?
asked 2017-06-03 04:50:11 UTC
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¿Por qué la mayoría de los alineadores no generan la operación CIGAR "X"?
asked 2017-06-03 04:58:11 UTC
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Fusión de datos de secuenciación para experimentos de ChIP-seq
asked 2017-06-03 17:42:58 UTC
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¿Por qué bwa-mem es el algoritmo estándar cuando se usa bwa?
asked 2017-06-03 18:58:27 UTC
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¿Cuál es la diferencia entre NGS, 2GS, SBS y HTS?
asked 2017-06-04 01:57:33 UTC
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¿Cuál es la diferencia entre la calidad del mapeo SAM y el valor Blast E?
asked 2017-06-04 04:01:34 UTC
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¿La chispa se usa ampliamente en bioinformática?
asked 2017-06-04 04:10:33 UTC
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Detección de variantes estructurales con datos MinION
asked 2017-06-04 18:21:05 UTC
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¿Qué métodos existen para calcular la similitud del perfil de expresión de ARN?
asked 2017-06-04 18:50:24 UTC
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¿Cómo puedo acelerar la llamada / corrección INDEL en archivos BAM?
asked 2017-06-05 04:25:12 UTC
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¿Cómo puedo crear un subconjunto eficiente de un archivo basado en líneas muy grande?
asked 2017-06-05 17:49:25 UTC
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Paquetes R para análisis de datos de pantallas CRISPR agrupadas
asked 2017-06-05 21:36:55 UTC
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¿Cuándo tener en cuenta las regiones genómicas incluidas en la lista negra en los análisis de datos de ChIP-seq?
asked 2017-06-05 22:15:40 UTC
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¿Cómo comparar grupos usando datos de WGS?
asked 2017-06-05 23:06:35 UTC
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¿Cómo realizo una prueba de ascendencia / mezcla en un solo archivo VCF?
asked 2017-06-06 17:44:58 UTC
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Conversión de nombres de genes de un formato de base de datos pública a otro
asked 2017-06-06 18:38:20 UTC
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¿Cómo se implementan las opciones de snakemake --cluster y --drama?
asked 2017-06-06 19:30:00 UTC
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Biblioteca para calcular alineaciones basadas en BWT
asked 2017-06-07 00:19:48 UTC
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¿Cuáles son algunas buenas prácticas a seguir durante el análisis de datos de metilación de ADN de EPIC?
asked 2017-06-07 01:58:15 UTC
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